嘉靖三十年，林兆恩創立三一教后，公開倡導三教合一論，并銳意終身從事這一活動。起初，沒有授徒。過了一段時間，才開始招收門徒。信徒黃州，一向與林兆恩友好，“每詳察言動問，心悅誠服，及執贄長跪，愿為弟子受而教”。林兆恩看他立志受業，心意懇切，就收他為第一個門徒，并開始授予他“心法”。隨后，黃大本、蕭應麟、黃葑、朱廷柱、鄭泳、黃陽、黃輝陽、林亹(meacute;n)，以及胞弟兆居、族弟兆誥、兆瓊、兆豸等也相繼受業，追隨林子。
在歷史上，任何宗教或學說的創立，都有一個草創和發展的過程，三一教的創立也不例外。林兆恩剛開始創立三一教時，曾遭到戚屬宗黨和地方官紳的反對和圍攻。據《林子本行實錄》記載：“時教主倡教，諸戚屬宗黨多有不率其化麗訕毀之者，教主往往虛心善處而曲全之。”莆田地方官鄭一鵬，屢次拜會林兆恩不得見，就寫作《莆陽輿議》，大肆攻擊嘲笑他。莆田士大夫“謗讀言（duacute;）朋興，見教主所著書多忌之”。他們起初以“好名”嘲笑他，繼而以“利口之人”諷刺他。地方鄉紳也把三教會一視為叛經離道、惑世誣民的異端。正因為如此，林兆恩為了避免節外生枝，或無中生有，或造謠中傷，在招收門徒時十分小心謹慎，嚴格挑選。“凡來求教者，教主必稽其素行何如，又須介紹往返數次，然后受之”。
為獲得民眾的信仰，抵御毀謗者的流言蜚語，林兆恩采取了以“艮背心法”為人治病的手段，來宣傳和推行他的學說。起初吸收的三一教徒大多數是“儒林受業者”，他們有一定的文化水準，對宣傳、推廣三一教起了很大的作用。林兆恩就把“試道妙為卻病之方”，對黃州等人說：“此獵較微權也。大道久湮，圣學難明，若不先之以心法之余緒，小試之貧且病者，與夫服藥之不效者，將三氏心性之學，驟以語之，誰其信之。故不得已而薄卻病以引之，俾知病而可以心法愈之，始信道而可以心法造也。”
林兆恩的“艮背心法”，為什么能為人治好病，也有他的理論依據《林子本行實錄》載：“蓋以人之病，皆本于心。心病則身病，心不病則身不病。其次又在于氣，氣逆則病，順之則不病故卻之之法，在持其志。hellip;hellip;從本原上用工夫，非由外鑠。夫茍篤信力行，自有能不藥而愈病者矣。”
據說，門徒黃州的女兒，不知什么原因，突然變成了瞎子——眼睛看不見了。黃州請教林子，要如何醫治。林子把“心法”傳授給他，很快就把女兒的眼睛治好——重見光明。鄉都憲劉渤，眼睛也有毛病——模糊不清，名醫名藥，百醫無效。黃州求拜林子，林子看劉勛是真心實意要求治療。就把“心法”授予他，劉勛的眼睛也很快治好了。還有一個姓陳的病婦，無醫無藥，生命垂危。林子見她家道寒貧，頓生憐憫之心，教給她“心法”，不久也恢復了健康。
林子初試艮背法，治病救人，效果顯著，名聲載道。那時，求醫者“無不隨病隨卻，隨叩隨應。其起死回生，扶危濟厄，悉皆捷于影響者”。他有治病的“迂見”幾十條，傳授的規矩很嚴。惟有志學道者，才傳授給他；有志立功者，才傳授給他。而對那些見利忘義、唯利是圖者，拒之于教門之外。
林兆恩教人受持心法，以去除疾病，關鍵是在于誠心誠意，專心而為。如果三心兩意，還想兼治其他的病，那就一定不是誠心誠意。他認為，既然不是誠心誠意，安能心寬?安能根治心病?他又說：“既不能心廣根治，體必不胖，面必不啐，至是而日無見其效者，惑之甚矣。蓋心為一身之主，或心有驚麗面青，或心有愧而面赤，可概見于此矣。”比如，吐血這一疾病，林兆恩治法與世人相反。世人惟恐其血吐出來，但不過是止留在胸膈。時間長了，淤血更加壅塞，生命就有危險了。林兆恩的治法是先打通患者的胸隔，讓淤血都吐出來，然后培養他的根源。這樣，就沒有治不好吐血的人。又如，醫生治病，第一要禁止病人喝酒吃肉。林兆恩卻“以酒能行血，肉能生血，不必禁之。惟在勤持心法而已”。他還告戒患病者：“若一心于道，一心于藥，則心不專，病安能治?”這就是說，要專心治病，不能心猿意馬。
林兆恩遵照明師的教導，把艮背心法“試之以病，病已而人信之”。他的秘方，就是明師傳授的真訣：“醫者意也，而方固在汝之心矣。”
因為林兆恩的艮背心法，是由九個邃漸深化的修持程序組成，又圍繞著“心”這一本體展開，故名為“九序心法”，或“九序”。他又把這套修身養性的方法說成是儒家秘密的“心傳法門”，故又稱為“孔門心法”。又因為九序心法第一序是“艮背”，或稱“九序心法”為“艮背心法”。它逐漸成為林兆恩思想和三一教的重要內容。萬歷年問，先后編輯成《九序摘言》和《九序內景圖》問世。后來，經門徒宣揚和試驗，不斷得到補充和完善。 （摘自柳濱著《林龍江傳奇》）
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